核技术工程系最早成立于上世纪50年代中期，国家为发展核武器而设立放射性地质与勘探系(对外称三系)。目前拥有核技术及应用、核资源与核勘查工程、矿产普查与勘探(铀矿地质与勘探方向)、核废物地质处置工程4个博士点；核资源勘查、辐射防护与环境保护、核技术及应用、矿产普查与勘探(铀矿地质与勘探方向)4个硕士点；2016年实行“核工程类”大类招生，有核工程与核技术、辐射防护与核安全、核化工与核燃料3个本科专业方向。全系在编教师26名，其中教授8人(3名博导，享受国务院政府特殊津贴2人，四川省学术与学科带头人1人，后备人选1人，省突出贡献专家2人)，副教授7人，讲师11人，博士学位22人。近五年来先后承担了包括国家自然科学基金项目、国防科技项目在内的30多项国家与省部级科研课题，获省部级科技成果奖9项、国家专利30多项，发表学术论文200多篇，其中SCI论文60余篇。